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種苗場指出，種子具有體積小、耐運輸及產值高的特性，故國際貿易流通需求頻繁，各國為了保護國內生態環境，乃針對貿易輸入的種子苗制訂相關檢疫規範，此外商業上亦對產品品質的要求也日漸高漲。該場為滿足國內業者需求，除GMO檢測之外也增加了植物病毒及細菌認證檢測項目，並自102年起受農委會防檢局委託辦理「輸出植物種子特定病原檢測作業」，協助國內種子業者取得檢疫證明書，以利將蔬菜種子外銷。

為有效管理基因改造作物(genetically modified organism, GMO)，台灣陸續建立GMO檢測技術，針對國內栽培作物進行監控，以確保農產品生產無受 GMO 混雜。種苗改良繁殖場為提高檢測技術及品質率先導入ISO/IEC 17025系統，並於民國97年通過全國認證基金會(TAF)驗證稽核，成為具TAF認證之檢測實驗室。

種苗場表示，TAF認證實驗室自認證通過至今已運作九年，期間內受託辦理收費檢測服務樣品高達951件，致力提高檢測能力，秉持公信力且確保檢測結果之正確性，持續臺南市將軍區小額貸款 推動並增加認證項目，為種子苗產品品質把關。

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